Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
USF1P22415 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
USF1P22415 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
USF1P22415 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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