Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRHP20396 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRHP20396 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRHP20396 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRHP20396 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRHP20396 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRHP20396 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms