Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDCP19113 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDCP19113 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HDCP19113 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HDCP19113 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HDCP19113 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDCP19113 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDCP19113 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDCP19113 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HDCP19113 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms