Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VCLP18206 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VCLP18206 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VCLP18206 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms