Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XBP1P17861 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
XBP1P17861 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms