Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL6A2P12110 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms