Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PCNAP12004 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCNAP12004 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCNAP12004 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms