Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM58BPP0C7Q3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM58BPP0C7Q3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms