Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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PKHD1P08F94 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PKHD1P08F94 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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