Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APODP05090 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APODP05090 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APODP05090 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APODP05090 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APODP05090 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APODP05090 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APODP05090 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APODP05090 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
APODP05090 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms