Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEMA4FO95754 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms