Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATP9BO43861 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP9BO43861 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms