Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNMO15061 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNMO15061 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNMO15061 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms