Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AGRPO00253 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRPO00253 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms