Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC00587B1AMM8 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms