Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
YJEFN3A6XGL0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms