Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDR42E2A6NKP2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms