Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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