Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms