Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UTP11Q9Y3A2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms