Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP164Q9UPV0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP164Q9UPV0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms