Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTF2Q9UNY4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms