Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TNFSF18Q9UNG2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms