Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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VAPAQ9P0L0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VAPAQ9P0L0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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