Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM248Q9NWD8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms