Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMBRD1Q9NUN5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms