Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms