Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TINF2Q9BSI4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TINF2Q9BSI4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms