Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
C2orf88Q9BSF0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms