Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERPUD2Q9BSE4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms