Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPAS2Q99743 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms