Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDRT15Q96T59 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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