Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRBNQ96SW2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRBNQ96SW2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms