Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIN3AQ96ST3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIN3AQ96ST3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms