Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR78Q96P69 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms