Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIC2Q96JB3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms