Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
RNF185Q96GF1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms