Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHMTQ93088 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms