Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EDAQ92838 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDAQ92838 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDAQ92838 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDAQ92838 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EDAQ92838 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EDAQ92838 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EDAQ92838 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms