Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RABGGTAQ92696 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RABGGTAQ92696 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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