Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LCN9Q8WX39 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LCN9Q8WX39 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms