Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
APOBEC4Q8WW27 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
APOBEC4Q8WW27 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms