Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATL2Q8NHH9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATL2Q8NHH9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms