Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
P3H3Q8IVL6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H3Q8IVL6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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