Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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USP43Q70EL4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
USP43Q70EL4 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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