Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC174Q6PII3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms