Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRNP1Q6NT89 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms