Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC9A4Q6AI14 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC9A4Q6AI14 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms