Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms