Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB6CQ53S08 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms